في تحليل HPLC، يكون حجم الجسيمات لتعبئة العمود الكروماتوغرافي صغيرًا ومن السهل حظره بواسطة جزيئات الشوائب. لذلك، يجب تصفية العينات والمذيبات مسبقًا لإزالة الملوثات الجسيمية وحماية الجهاز. يتطلب التحليل اللوني الأيوني، والذي يستخدم عادة في التحليل البيئي، عدم إدخال أي ملوثات غير عضوية في المعالجة المسبقة للعينة.