Стерилизация фильтрами, то есть удаление микроорганизмов физическими средствами, такими как просеивание или адсорбция фильтрующего материала, является широко используемым методом стерилизации. Широко используется метод фильтрации, а некоторые материалы, подлежащие стерилизации, нельзя нагревать, например, многие витаминные растворы. Помимо использования в производстве напитков и лекарств, воздух часто стерилизуют путем фильтрации. Когда мы обычно проводим микробиологические эксперименты, стерилизованный контейнер обычно затыкают выпускное отверстие ватой, которая фактически фильтрует воздух для удаления микроорганизмов, чтобы в воздухе, поступающем в контейнер, не было микробного загрязнения.