Bij HPLC-analyse is de deeltjesgrootte van de pakking van de chromatografische kolom klein en gemakkelijk geblokkeerd door verontreinigende deeltjes. Daarom moeten monsters en oplosmiddelen vooraf worden gefilterd om deeltjesvormige verontreinigingen te verwijderen en het instrument te beschermen.
Bovendien vereist de chromatografie die gewoonlijk wordt gebruikt bij milieuanalyses dat er geen anorganische verontreinigingen worden geïntroduceerd tijdens de voorbehandeling van het monster.
