הבקבוקון האוטומטי עשוי מחומרי גלם איכותיים. יש לו עמידות בטמפרטורה גבוהה ועמידות בפני קורוזיה. המחיצה של בקבוקוני הדגימה האוטומטית עשויה מחומרים באיכות גבוהה כדי להבטיח תפקוד תקין ונמצאת בשימוש נרחב בעיצובים של מספר הזרקות או מחזורי הזרקה ארוכים יותר, כמו גם בכרומטוגרפים של גז ונוזלים.