בקבוקונים של כרומטוגרפיה אוטומטית נמצאים בשימוש נרחב בכרומטוגרפיה, כימיה, רפואה ושאר. בקבוקוני דגימה אוטומטית עשויים בדרך כלל מזכוכית הידרוליטית או בורוסיליקט, עם מפרטים שונים. עיצובים שונים של פה בקבוקון עונים על צרכים בפועל שונים.
