La sterilizzazione del filtro, ovvero la rimozione di microrganismi con mezzi fisici come lo screening o l'adsorbimento del materiale del filtro, è un metodo di sterilizzazione comunemente usato. Il metodo di filtrazione è ampiamente utilizzato e alcuni materiali che devono essere sterilizzati non possono essere riscaldati, come molte soluzioni di vitamina. Oltre ad essere utilizzato nella produzione di bevande e farmaci, l'aria è spesso sterilizzata dalla filtrazione. Quando di solito facciamo esperimenti di microbiologia, il contenitore sterilizzato è generalmente collegato al cotone all'uscita, che in realtà si sta filtrando per rimuovere i microrganismi nell'aria, in modo che non vi sia contaminazione microbica nell'aria che entra nel contenitore.
