La esterilización por filtración, es decir, la eliminación de microorganismos por medios físicos como la detección o la adsorción del material del filtro, es un método de esterilización comúnmente utilizado. El método de filtración es muy utilizado y algunos materiales que necesitan esterilizarse no pueden calentarse, como muchas soluciones vitamínicas. Además de utilizarse en la producción de bebidas y medicamentos, el aire suele esterilizarse mediante filtración. Cuando solemos hacer experimentos de microbiología, el recipiente esterilizado suele estar tapado con algodón en la salida, que en realidad está filtrando para eliminar los microorganismos del aire, de modo que no haya contaminación microbiana en el aire que ingresa al recipiente.
