Die Filtersterilisation, also die Entfernung von Mikroorganismen durch physikalische Maßnahmen wie Siebung oder Filtermaterialadsorption, ist eine häufig verwendete Sterilisationsmethode. Die Filtrationsmethode ist weit verbreitet und einige zu sterilisierende Materialien können nicht erhitzt werden, beispielsweise viele Vitaminlösungen. Neben der Verwendung bei der Herstellung von Getränken und Medikamenten wird die Luft häufig durch Filtration sterilisiert. Wenn wir normalerweise mikrobiologische Experimente durchführen, wird der sterilisierte Behälter normalerweise am Auslass mit Baumwolle verschlossen, die tatsächlich filtert, um Mikroorganismen in der Luft zu entfernen, sodass keine mikrobielle Kontamination in der in den Behälter eindringenden Luft entsteht.