In der HPLC -Analyse ist die Partikelgröße der chromatographischen Säulenpackung klein und es ist leicht, durch Verunreinigungspartikel blockiert zu werden. Daher müssen Proben und Lösungsmittel im Voraus filtriert werden, um Partikelverschmutzungen zu entfernen und das Instrument zu schützen. Die Ionenchromatographie, die häufig in der Umweltanalyse verwendet wird, erfordert auch, dass in der Probenvorbehandlung keine anorganischen Schadstoffe eingeführt werden.