Defnyddir chwistrelliad awtomatig cromatograffig yn gyffredin mewn labordai dadansoddol i gyflwyno samplau i offerynnau cromatograffaeth, megis cromatograffaeth hylif perfformiad uchel (HPLC) neu systemau cromatograffaeth nwy (GC). Mae'n cynnwys defnyddio samplwr awtomatig, sef dyfais sy'n awtomeiddio'r broses chwistrellu sampl, trwybwn sampl cynyddol, gwell atgynhyrchedd, a llai o drin â llaw, a thrwy hynny leihau'r risg o gamgymeriadau a halogiad.